قبرس در حال حاضر با چالش‌های متعددی در زمینه افزایش تعداد پناه‌جویان خود مواجه است و سعی دارد با افزایش امکان بازگشت داوطلبانه مهاجران به کشورهای خود، به اعتراض ساکنان ناراضی در زمینه مهاجرپذیری کشور پاسخ دهد.
ورود گسترده پناه‌جویان به قبرس، بحث‌های داغی را درباره محدودیت‌های آن در پذیرش افراد بیشتر ایجاد کرده است. بسیاری از ساکنان این کشور بیم آن دارند که ورود مهاجران نه‌تنها مسائل اجتماعی-اقتصادی و امنیتی، بلکه یک تهدید هویتی، جمعیتی و حتی وجودی برای کشور آن‌ها به وجود آورد. ساکنان باور دارند که چنانچه جمعیت قبرس حدود ۸۰۰ هزار نفر باشد، ۲۵ یا ۳۰ درصد از آن‌ها معادل ۲۵۰ هزار نفر، مهاجران خارجی هستند. در صورت پذیرش هر یک از این افراد آن‌ها با خانواده‌های خود که در حال حاضر دور از یکدیگر هستند، ساکن قبرس خواهند شد که این امر تعداد جمعیت خارجی کشور را بیشتر می‌کند.
پناه‌جویان قبرس با مشکلات مذهبی مواجه هستند. کلیسای ارتدکس این کشور دیدگاه بسیار روشنی درباره مهاجرت دارد و ترکیه را به تلاش برای تغییر وضعیت جمعیتی این کشور متهم کرده است. کلیسا باور دارد این حقیقت که اکثر پناهجویان دین دیگری دارند، بر جامعه قبرس تأثیر می‌گذارد. تحت فشار کلیسا و نارضایتی اجتماعی فزآینده، دولت در تلاش است تا شرایط بازگشت داوطلبانه پناه‌جویان را به کشورهای خود افزایش دهد. قبرس چهارمین کشور برتر اتحادیه اروپا در این زمینه نوع خروج‌ها است و در نظر دارد با مهاجرت غیرقانونی مبارزه کند تا نه به‌واسطه تصمیم‌گیری قاچاقچیان یا دیگر گروه‌های مهاجرتی، بلکه براساس قوانین بین‌المللی تصمیم بگیرد که چه کسی از مرزهای آن عبور می‌کند. دولت این کشور در حال حاضر بررسی تمام درخواست‌های پناهندگی مهاجران سوری را نیز به مدت ۱۴ ماه متوقف کرده است.